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乙酰CoA具有硫酯鍵,乙;凶銐蚰芰颗c草酰乙酸的羧基進行醛醇型縮合。首先從CH3CO基上除去一個H+,生成的陰離子對草酰乙酸的羰基碳進行親核攻擊,生成檸檬酰CoA中間體,然后高能硫酯鍵水解放出游離的檸檬酸,使反應不可逆地向右進行。該反應由檸檬酸合成酶催化,是很強的放能反應。
此反應是不可逆的,是三羧酸循環(huán)中的限速步驟,ADP是異檸檬酸脫氫酶的激活劑,而ATP,NADH是此酶的抑制劑。