病毒的起源學(xué)說：

（1）退化性起源學(xué)說。退化性起源學(xué)說認為病毒是細胞內(nèi)寄生物的退化形式。這種細胞內(nèi)寄生的產(chǎn)生原因可能是由于微生物對某種不能穿過細胞膜的代謝發(fā)生了嚴(yán)重依賴。在細胞內(nèi)，這類寄生物可以在不影響其生存的情況下逐漸丟失部分生物學(xué)功能。它們所必需保留的功能是具有可進行自主復(fù)制的DNA復(fù)制原點（順式元件）、可以對復(fù)制進行調(diào)控的反式調(diào)控蛋白，以及能與宿主生物合成及復(fù)制系統(tǒng)相互作用的順式和反式功能。最終的選擇結(jié)構(gòu)，就可產(chǎn)生一種專性細胞內(nèi)寄生的DNA分子或質(zhì)粒。

退化性起源學(xué)說可以把病毒的起源解釋為兩個階段：首先，寄生物在細胞內(nèi)產(chǎn)生獨立復(fù)制的DNA質(zhì)粒，然后，編碼寄生物亞細胞結(jié)構(gòu)單位的基因發(fā)生突變，形成病毒的衣殼蛋白。隨著進化的發(fā)生，新獲得的可在細胞間轉(zhuǎn)移的特性被進一步選擇下來。

（2）病毒起源于宿主細胞中的RNA和（或）DNA成分的學(xué)說。這種學(xué)說認為，病毒是正常的細胞組分在進化過程中獲得了自主復(fù)制的能力獨立進化而來的。該學(xué)說能解釋所有病毒的起源：DNA病毒起源于質(zhì)?；蜣D(zhuǎn)移因子；反轉(zhuǎn)錄病毒起源于反轉(zhuǎn)座子；RNA病毒起源于自主復(fù)制的mRNA.

（3）病毒起源于具有自主復(fù)制功能的原始大分子的學(xué)說，即病毒起源于自主復(fù)制的RNA分子。核糖核酸多聚體具有自主復(fù)制的信息和能力。由于發(fā)現(xiàn)RNA分子具有催化化學(xué)反應(yīng)的能力使得RNA為生命和病毒的起源的學(xué)說變得更具有吸引力。