醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)整理了溫州醫(yī)學(xué)院科研機(jī)構(gòu)如下：

截至2014年2月，學(xué)校擁有國(guó)家工程技術(shù)研究中心1個(gè)，省部共建國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室培育基地1個(gè)，省部級(jí)及以上重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室（研究中心）11個(gè)，其中包括省部共建教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1個(gè)、省部共建教育部工程研究中心1個(gè)、衛(wèi)生部研究中心1個(gè)、衛(wèi)生部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1個(gè)、浙江省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室7個(gè)。

國(guó)家工程技術(shù)研究中心：國(guó)家眼視光工程技術(shù)研究中心；

省部共建教育部工程研究中心：現(xiàn)代眼視光技術(shù)和裝備教育部工程研究中心；

衛(wèi)生部研究中心：衛(wèi)生部視光學(xué)研究中心；

國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室培育基地：醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)搜集|整理眼視光學(xué)和視覺(jué)科學(xué)；

浙江省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室：

浙江省眼視光學(xué)重點(diǎn)研究實(shí)驗(yàn)室；

浙江省醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室；

浙江省眼視光學(xué)重點(diǎn)研究實(shí)驗(yàn)室；

浙江省生物技術(shù)制藥工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室；

浙江省模式生物技術(shù)與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室；

浙江省麻醉學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室；

浙江省神經(jīng)老化與疾病研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室；

省部共建教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室：檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)；

衛(wèi)生部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室：衛(wèi)生部視覺(jué)科學(xué)研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室；

協(xié)同創(chuàng)新中心；

浙江省“2011協(xié)同創(chuàng)新中心”：眼視光行業(yè)產(chǎn)業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心。