北京協(xié)和醫(yī)學院學術(shù)期刊：

《中國醫(yī)學科學院學報》：美國生物醫(yī)學文獻聯(lián)機數(shù)據(jù)庫（Medical Literature Analysis and Retrieval System， MEDLARS/PubMed）及其《醫(yī)學索引》（Index Medicus， IM）、荷蘭醫(yī)學文摘數(shù)據(jù)庫 （EMBASE）、美國化學文摘數(shù)據(jù)庫及其《化學文摘》（Chemical Abstracts，CA）、世界衛(wèi)生組織《醫(yī)學増補文摘》光盤數(shù)據(jù)庫（ExtraMED）、俄羅斯《文摘雜志》（Рефсратнвньй Журнал， РЖ/AJ）及波蘭《哥百尼索引》（Index Copernicus，IC）收錄期刊。

《中國醫(yī)藥導報》：中國科技論文統(tǒng)計源期刊（中國科技核心期刊）、中國學術(shù)期刊綜合評價數(shù)據(jù)庫統(tǒng)計源期刊、中國科技論文與引文數(shù)據(jù)庫收錄期刊、中國生物醫(yī)學文獻檢索分析數(shù)據(jù)庫收錄期刊、解放軍醫(yī)學圖書館中文生物醫(yī)學期刊文獻數(shù)據(jù)庫收錄期刊，是衛(wèi)生部和國家食品藥品監(jiān)督管理局核準的允許發(fā)布處方藥的醫(yī)學、藥學專業(yè)刊物。

《中國循環(huán)》：中文核心期刊、ST 日本科學技術(shù)振興機構(gòu)數(shù)據(jù)庫（日）中國科學引文數(shù)據(jù)庫（CSCD—2008）收錄期刊。

《中華血液學》：《CA》、《Index Medicus/Medline》、《Biological Abstracts》、《Medline Exp-ress》、《CBMdisc》收錄期刊。

《協(xié)和醫(yī)學》、《中國分子心臟病學》、《國際皮膚性病學》、醫(yī)學教育網(wǎng)搜集|整理《國際生物醫(yī)學工程》、《國外醫(yī)學情報》、《醫(yī)學研究》、《中國骨與關(guān)節(jié)外科》、《癌癥進展》、《Chinese Medical Sciences Journal》、《Chinese Journal of Integrative Medicine》、《中國衛(wèi)生政策研究》、《中華骨質(zhì)疏松和骨礦鹽疾病》、《中華臨床免疫和變態(tài)反應(yīng)》等數(shù)十種。