福建中醫(yī)藥大學原名福建中醫(yī)學院，創(chuàng)建于1958年，是我國創(chuàng)辦較早的高等中醫(yī)藥院校之一，是福建省重點建設高校，2010年3月經教育部批準更名為福建中醫(yī)藥大學。

學校設有13個學院（部），2個研究院；有中醫(yī)學、中西醫(yī)結合等2個博士學位授權一級學科，17個博士學位授權點，有中醫(yī)學、中西醫(yī)結合、臨床醫(yī)學、藥學、中藥學、護理學等6個碩士學位授權一級學科，醫(yī)學教|育網搜集整理45個碩士學位授權點，有臨床醫(yī)學、中藥學、藥學、護理學等4個碩士專業(yè)學位類別；有中醫(yī)學、中西醫(yī)結合等2個博士后科研流動站；有中醫(yī)學、七年制中醫(yī)學、針灸推拿學、中西醫(yī)臨床醫(yī)學、臨床醫(yī)學、藥學、中藥學、藥物制劑、制藥工程、市場營銷、護理學、公共事業(yè)管理、醫(yī)學影像學（醫(yī)學影像技術）、食品科學與工程、生物醫(yī)學工程、康復治療學、信息管理與信息系統(tǒng)、醫(yī)學實驗技術、醫(yī)學檢驗技術、海洋藥學等20個本科專業(yè)。現(xiàn)有全日制在校生1.1萬多人，其中研究生1300多人。