（一）細(xì)菌絕大多數(shù)（95%以上）的醫(yī)院內(nèi)感染為細(xì)菌所致，其中60%～65%為革蘭陰性桿菌，主要為大腸桿菌、肺炎桿菌、變形桿菌等腸桿菌科細(xì)菌、綠膿桿菌和不動(dòng)桿菌屬，聚團(tuán)腸桿菌污染輸液后引起敗血癥的情況近年來時(shí)有報(bào)道。新生兒病房，鼠傷寒桿菌及痢疾桿菌感染的暴發(fā)流行也偶有發(fā)生。引起醫(yī)院內(nèi)感染的病原菌常對(duì)多種抗菌藥物耐藥。

金黃色葡萄球菌（金葡菌）、表皮葡萄球菌（表葡菌）等凝固酶陰性葡萄球菌和腸球菌是醫(yī)院內(nèi)感染常見的革蘭陽性球菌。金葡菌耐藥性仍很嚴(yán)重，目前臨床上產(chǎn)青霉素酶的菌株達(dá)90%以上，耐甲氧西林金葡菌也日益增多，在一些大醫(yī)院中可占葡萄球菌臨床分離株的60%或以上，并可在醫(yī)院某些病區(qū)造成爆發(fā)流行。在留置靜脈導(dǎo)管、靜脈導(dǎo)管及腦室引流管病人中以表葡菌較為常見，呈上升趨勢(shì)，表葡菌亦可引起骨科人工裝置、人工心臟瓣膜等的感染。腸球菌主要引起尿路感染和傷口感染，近年來隨著頭孢菌素類的廣泛應(yīng)用，各種腸球菌感染有增多趨勢(shì)。B組溶血性鏈球菌為新生兒腦膜炎和敗血癥的主要致病菌，A組溶血性鏈球菌可引起術(shù)后傷口感染。

嗜肺軍團(tuán)菌和其它軍團(tuán)菌屬為醫(yī)院內(nèi)肺部感染常見病原菌。據(jù)報(bào)道嗜肺軍團(tuán)菌肺炎的發(fā)病率約占醫(yī)院內(nèi)獲得性肺炎的3～10%.生長較快的分支桿菌，如鳥分支桿菌（Mavium）、龜分支桿菌（M.chelonei）和偶然分支桿菌（M.fortuitum）等可在心臟手術(shù)后造成胸骨骨髓炎、心包炎和心內(nèi)膜炎，以及其它外科手術(shù)傷口感染和肌肉注射引起的感染。胎兒彎曲桿菌為腹瀉的致病菌之一。

類桿菌為厭氧菌感染最常見的病原菌，可引起胃腸道和婦科手術(shù)后的腹腔和盆腔感染，梭桿菌屬、消化球菌和放線菌屬等可引起口腔及呼吸系統(tǒng)的感染，如吸入性肺炎、壞死性肺炎、肺膿腫、膿胸等。由類桿菌、丙酸桿菌所致的敗血癥和心內(nèi)膜炎并非少見。抗生素應(yīng)用后發(fā)生的腸炎系由難辨梭菌所致，后者可在醫(yī)院內(nèi)散播。

（二）真菌念珠菌、曲菌和某些其它條件致病性真菌為二重感染的常見致病菌，多發(fā)生于應(yīng)用抗生素和皮質(zhì)激素的病人以及粒細(xì)胞減少患者。念珠菌屬中80%為白色念珠菌，近年來熱帶念珠菌、克柔念珠菌有增多趨勢(shì)。念珠菌除為醫(yī)院內(nèi)肺部感染和消化道感染的病原菌外，也可在靜脈保留插管時(shí)引起敗血癥和免疫缺陷病人造成粘膜皮膚念珠菌病。曲菌為急性非淋巴細(xì)胞白血病病人感染中常見致病菌之一，曲菌肺部感染亦并非少見。此外在免疫缺陷病人中隱球菌性腦膜炎也可發(fā)生。由于繃帶和筒形石膏污染可造成根霉菌和曲菌蜂窩織炎。

（三）病毒病毒也是醫(yī)院內(nèi)感染的重要病原體。醫(yī)。學(xué)教育網(wǎng)搜集整理常見的病毒性院內(nèi)感染有呼吸道合胞病毒和副流感病毒所致的呼吸道感染、流感、風(fēng)疹、病毒性肝炎等。新生兒對(duì)鼻病毒最易感，柯薩奇病毒B可引起新生兒感染并形成流行。由輪狀病毒和諾瓦克因子所致的腹瀉多發(fā)生于嬰兒和老年人。單純皰疹病毒、巨細(xì)胞病毒和皰疹-水痘病毒皆可在醫(yī)院內(nèi)形成流行。

（四）其他沙眼衣原體所致的結(jié)膜炎和肺炎見于新生兒。尿支原體和Gardnarellavaginalis可寄殖于腎移植病人，后者也易感染肺孢子蟲和弓形體。輸血時(shí)可傳播瘧疾等。阿米巴原蟲、犬弓首蛔蟲和糞類圓線蟲感染常見于精神病病人或智能低下兒童。類圓線蟲也可借器官移植而散播。