（一）推進醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革。擬定自治區(qū)衛(wèi)生改革與發(fā)展戰(zhàn)略目標、規(guī)劃和方針政策，起草衛(wèi)生、和食品安全、藥品、醫(yī)療器械相關法規(guī)規(guī)章草案，依法制定有關標準和技術規(guī)范。

（二）研究提出自治區(qū)衛(wèi)生資源配置標準，統(tǒng)籌規(guī)劃與協(xié)調(diào)全區(qū)衛(wèi)生資源配置，指導區(qū)域衛(wèi)生規(guī)劃的編制和實施。

（三）負責全區(qū)衛(wèi)生應急工作。指定衛(wèi)生應急預案和政策措施，負責突發(fā)公共衛(wèi)生事件監(jiān)測預警和風險評估，指導實施突發(fā)公共衛(wèi)生事件預防控制與應急處置，發(fā)布突發(fā)公共衛(wèi)生事件應急處置信息。

（四）負責疾病預防控制工作，指定自治區(qū)免疫規(guī)劃及政策措施，指定傳染病、地方病、職業(yè)病、慢性病和其他重大疾病防治規(guī)劃與措施并組織實施。協(xié)調(diào)有關部門對重大疾病實施防控與干預，發(fā)布法定報告?zhèn)魅静∫咔樾畔ⅰ?

（五）組織制定并實施全區(qū)農(nóng)村衛(wèi)生發(fā)展規(guī)劃和政策措施，負責新型農(nóng)牧區(qū)合作醫(yī)療的綜合治理。

（六）制定社區(qū)衛(wèi)生、婦幼衛(wèi)生發(fā)展規(guī)劃和政策措施，規(guī)劃并指導全區(qū)社區(qū)衛(wèi)生服務體系建設，負責婦幼保健的綜合管理和監(jiān)督。

（七）負責自治區(qū)醫(yī)療服務的全行業(yè)監(jiān)督管理，制定醫(yī)療服務、技術、質(zhì)量和采供血機構(gòu)管理的政策、規(guī)范、標準，建立醫(yī)療機構(gòu)醫(yī)療服務評價和監(jiān)督體系。

（八）承擔食品安全綜合協(xié)調(diào)、組織查處食品安全重大事故的責任，組織制定食品安全地方標準，接受食品安全企業(yè)標準備案，負責食品及相關產(chǎn)品的安全風險評估、預警工作，統(tǒng)一發(fā)布重大食品安全信息。

（九）承擔建立國家基本藥物制度相關工作。根據(jù)國家藥物政策和基本藥物制度要求，擬定自治區(qū)藥物政策和基本藥物在各級各類醫(yī)療機構(gòu)的臨床應用規(guī)范，指導醫(yī)療機構(gòu)藥物臨床應用及安全監(jiān)管工作。

（十）指導規(guī)范衛(wèi)生行政執(zhí)法工作。按照職責分工，負責職業(yè)衛(wèi)生、放射衛(wèi)生、環(huán)境衛(wèi)生、學校衛(wèi)生和公共場所、飲用水的衛(wèi)生監(jiān)督管理，負責傳染病防治監(jiān)督；整頓和規(guī)范醫(yī)療服務市場，組織查出違法違規(guī)行為。

（十一）貫徹中西醫(yī)并重的方針，協(xié)調(diào)有關部門共同發(fā)展現(xiàn)代醫(yī)藥和傳統(tǒng)醫(yī)藥（中醫(yī)藥、民族醫(yī)藥）事業(yè)。

（十二）組織制定醫(yī)藥衛(wèi)生科技發(fā)展規(guī)劃，組織實施重點醫(yī)藥衛(wèi)生科研攻關項目，參與制定醫(yī)學教育發(fā)展規(guī)劃，組織開展繼續(xù)醫(yī)學教育和畢業(yè)后醫(yī)學教育工作。

（十三）指導全區(qū)衛(wèi)生人才隊伍建設工作，組織擬定自治區(qū)衛(wèi)生人才發(fā)展規(guī)劃和衛(wèi)生人員職業(yè)道德規(guī)范，會同有關部門組織實施衛(wèi)生專業(yè)技術人員資格標準。

（十四）組織指導衛(wèi)生方面的對外交流與合作及衛(wèi)生援外有關工作。

（十五）負責衛(wèi)生廳保健委員會確定的保健對象的醫(yī)療保健工作，承擔自治區(qū)重要會議與重大活動的醫(yī)療衛(wèi)生保障工作

（十六）承擔自治區(qū)艾滋病防治工作委員會、自治區(qū)愛國衛(wèi)生運動委員會的具體工作。

（十七）承辦自治區(qū)人民政府交辦的其他事項。