上海中醫(yī)藥大學學科建設：

截止2013年11月，學校建有國家重點學科4個，國家重點學科（培育）2個，國家重點學科數(shù)居全國中醫(yī)院校第二、上海地方高校之首。有中醫(yī)學、中西醫(yī)結合醫(yī)學、中藥學3個一級學科博士點，15個二級學科博士點，23個碩士點，3個博士后流動站，博士學位授予專業(yè)覆蓋全部中醫(yī)藥學科醫(yī)學教|育網(wǎng)搜集整理。在2010年的全國博士后流動站評估中，中藥學科被評為全國唯一的中藥一級學科“優(yōu)秀”流動站。有38個中管局重點學科，9個上海市重點學科（上海高校學科），5個上海市教委重點學科。

2012年教育部學科評估，學校中藥學一級學科排名全國第一，中醫(yī)學一級學科排名全國第二，中西醫(yī)結合一級學科排名全國第三。

一級學科博士點（3個）：中醫(yī)學、中西醫(yī)結合醫(yī)學、中藥學。

博士后流動站（3個）：中醫(yī)學、中西醫(yī)結合醫(yī)學、中藥學。

國家重點學科（4個）：中醫(yī)外科、中藥學、中醫(yī)內科、中醫(yī)骨傷科學。

國家重點學科（培育）（2個）：中醫(yī)醫(yī)史文獻學、針灸推拿學。

國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)藥重點學科（38個）：藥用植物學、中醫(yī)診斷學、中醫(yī)各家學說、中醫(yī)藥工程學、中醫(yī)肝膽病學、中醫(yī)傳染病學、中醫(yī)腎病學、中醫(yī)腫瘤病學、中醫(yī)肛腸病學、中醫(yī)骨傷科學、中西醫(yī)結合臨床（岳陽）、針灸學、推拿學、古漢語與醫(yī)古文、內經(jīng)學、中西醫(yī)結合基礎、中醫(yī)基礎理論、中醫(yī)復雜科學、中醫(yī)史學、中醫(yī)文化學、中醫(yī)文獻學、中醫(yī)痹病學、中醫(yī)瘡瘍病學、中醫(yī)護理學（龍華）、中醫(yī)急診學、中醫(yī)乳腺病學、中醫(yī)養(yǎng)生學、中西醫(yī)結合臨床（普陀）、中醫(yī)全科醫(yī)學、中西醫(yī)結合臨床（曙光）、中醫(yī)護理學（曙光）、中醫(yī)藥信息學、中醫(yī)“治未病”學、中醫(yī)康復學、中醫(yī)皮膚病學、中醫(yī)血液病學、中醫(yī)兒科學、中醫(yī)神志病學。

上海市重點學科（9個）：中醫(yī)婦科學、中醫(yī)診斷學、中醫(yī)系統(tǒng)實驗方劑學、中醫(yī)醫(yī)史文獻、中藥學、針灸推拿學、中醫(yī)骨傷科學、中醫(yī)外科學、中醫(yī)內科學。

上海高校學科（4個）：中藥學、科學技術史、中醫(yī)學、中西醫(yī)結合。

上海市教委重點學科（5個）：中藥臨床藥理學、中藥藥劑學、中醫(yī)診斷學、中醫(yī)脾胃病學、中西醫(yī)結合基礎。