福建醫(yī)科大學的院系專業(yè)：

截至2014年9月底，學校有福建醫(yī)科大學基礎(chǔ)醫(yī)學院、福建醫(yī)科大學公共衛(wèi)生學院、福建醫(yī)科大學醫(yī)學技術(shù)與工程學院、福建醫(yī)科大學藥學院、福建醫(yī)科大學護理學院、福建醫(yī)科大學臨床教學部、福建醫(yī)科大學人文學院、福建醫(yī)科大學外國語學院、福建醫(yī)科大學協(xié)和臨床醫(yī)學院、福建醫(yī)科大學第一臨床醫(yī)學院、福建醫(yī)科大學第二臨床醫(yī)學院、福建醫(yī)科大學口腔醫(yī)學院、福建醫(yī)科大學省立臨床醫(yī)學院、福建醫(yī)科大學?？偱R床醫(yī)學院、思想政治理論課教學研究部、體育教學研究部、研究生學院、海外教育學院、成人教育學院醫(yī)學教|育網(wǎng)搜集整理、繼續(xù)教育學院等20個學院（部）。

學校設(shè)有七年制臨床醫(yī)學、五年制臨床醫(yī)學、預防醫(yī)學、口腔醫(yī)學、醫(yī)學檢驗技術(shù)、麻醉學、護理學、醫(yī)學影像學、藥學、公共事業(yè)管理、社會工作、康復治療學、應用心理學、 藥物制劑、英語、基礎(chǔ)醫(yī)學、臨床藥學、生物制藥、食品質(zhì)量與安全、醫(yī)學影像技術(shù)、衛(wèi)生檢驗與檢疫、醫(yī)學實驗技術(shù)、生物信息學、生物醫(yī)學工程、藥物分析等25個本科專業(yè)。